Откриха е скрита „врата“ в човешката клетка, през която влиз...
От първите дни на пандемията на Коронавирус учените интензивно изследват механизмите, които разрешават на тежкия изострен респираторен коронавирусен синдром 2 (SARS-CoV-2) да навлезе и да болести здрави човешки кафези.
В началото на пандемията бе създадена от учени от Калифорнийския университет детайлна визуализация на шиповия протеин на SARS-CoV-2, който дейно се захваща за нашите клетъчни рецептори.
Сега този екип, воден от Роми Амаро (Rommie Amaro), дружно с нейните сътрудници Калифорнийския университет в Сан Диего, Университета в Питсбърг, Тексаския университет в Остин, Колумбийския университет и Университета на Уисконсин-Милуоки, са разкрили по какъв начин гликаните - молекули, които образуват захарен излишък по краищата на шиповия протеин - работят като врата за зараза.
Амаро счита, че откритието отваря евентуални благоприятни условия за нови лечебни средства за противопоставяне на инфекцията с SARS-CoV-2. Ако гликановите врати могат да бъдат фармакологично заключени в затворено състояние, това дейно ще предотвратява отварянето за нахлуване на вирус и инфекцията.
Покритието на шипа от гликани оказва помощ да се заблуди имунната система на индивида, защото се демонстрира като нищо повече от захарен излишък. Суперкомпютърните технологии разрешиха на откривателите да разработят динамични симулации, които разкриват, че гликановите порти се задействат от една позиция на друга, предлагайки значима част от историята на инфекцията.
„ Всъщност успяхме да следим отварянето и затварянето “, споделя Амаро.
" Това е едно от в действителност хубавите неща, които тези симулации ни дават - опцията да забележим в действителност детайлни филми. Когато ги гледаме, осъзнаваме, че виждаме нещо, което другояче бихме пренебрегнали ".
„ Стандартните техники биха претендирали години, с цел да се симулира този развой на отваряне, само че с усъвършенстваните принадлежности за симулация на на моята лаборатория успяхме да осезаем процеса единствено за 45 дни “, изяснява съавторът Лилиан Чонг (Lillian Chong) от Университета в Питсбърг.
Дигиталните симулации са извършени първо на суперкомпютъра Comet в Калифорнийския университет в Сан Диего, а по-късно на системата Longhorn в Тексаския университет. Тази изчислителна мощност обезпечава на откривателите взор на атомно равнище на рецептор-свързващият домейн (RBD) на шиповия протеин от повече от 300 гледни точки. Изследванията разкриват гликан " N343 " като свързващ детайл, който слага RBD от позиция " надолу " до " нагоре ", с цел да разреши достъп до ACE2 рецептора на клетката гостоприемник. Изследователите разказват активирането на N343 гликан като сходно на " молекулен лост ".
Джейсън Маклелан (Jason McLellan), доцент по молекулярна биология в Тексаския университет в Остин и неговият екип основават разновидности на шиповия протеин и тестват по какъв начин неналичието на гликанова врата въздейства върху способността на RBD да се отваря.
" Ние показахме, че без тази врата RBD на шиповия протеин не може да стане нужната конформация, с цел да се инфектират клетките ", декларира Маклелан.
Публикуваното на 19 август в списание Nature Chemistry изследване разказва откриването на гликанови " порти ", които се отварят, с цел да разрешат навлизането на SARS-CoV-2.
Симулациите, ръководени от суперкомпютри, изобразяват гликана N343 (в магента - лилаво-червен цвят), работи като молекулен лост, с цел да отвори рецепторния свързващ домейн на SARS-CoV-2 или RBD (циан - синьо-зелен) от позиция „ надолу “ до „ нагоре “.
В началото на пандемията бе създадена от учени от Калифорнийския университет детайлна визуализация на шиповия протеин на SARS-CoV-2, който дейно се захваща за нашите клетъчни рецептори.
Сега този екип, воден от Роми Амаро (Rommie Amaro), дружно с нейните сътрудници Калифорнийския университет в Сан Диего, Университета в Питсбърг, Тексаския университет в Остин, Колумбийския университет и Университета на Уисконсин-Милуоки, са разкрили по какъв начин гликаните - молекули, които образуват захарен излишък по краищата на шиповия протеин - работят като врата за зараза.
Амаро счита, че откритието отваря евентуални благоприятни условия за нови лечебни средства за противопоставяне на инфекцията с SARS-CoV-2. Ако гликановите врати могат да бъдат фармакологично заключени в затворено състояние, това дейно ще предотвратява отварянето за нахлуване на вирус и инфекцията.
Покритието на шипа от гликани оказва помощ да се заблуди имунната система на индивида, защото се демонстрира като нищо повече от захарен излишък. Суперкомпютърните технологии разрешиха на откривателите да разработят динамични симулации, които разкриват, че гликановите порти се задействат от една позиция на друга, предлагайки значима част от историята на инфекцията.
„ Всъщност успяхме да следим отварянето и затварянето “, споделя Амаро.
" Това е едно от в действителност хубавите неща, които тези симулации ни дават - опцията да забележим в действителност детайлни филми. Когато ги гледаме, осъзнаваме, че виждаме нещо, което другояче бихме пренебрегнали ".
„ Стандартните техники биха претендирали години, с цел да се симулира този развой на отваряне, само че с усъвършенстваните принадлежности за симулация на на моята лаборатория успяхме да осезаем процеса единствено за 45 дни “, изяснява съавторът Лилиан Чонг (Lillian Chong) от Университета в Питсбърг.
Дигиталните симулации са извършени първо на суперкомпютъра Comet в Калифорнийския университет в Сан Диего, а по-късно на системата Longhorn в Тексаския университет. Тази изчислителна мощност обезпечава на откривателите взор на атомно равнище на рецептор-свързващият домейн (RBD) на шиповия протеин от повече от 300 гледни точки. Изследванията разкриват гликан " N343 " като свързващ детайл, който слага RBD от позиция " надолу " до " нагоре ", с цел да разреши достъп до ACE2 рецептора на клетката гостоприемник. Изследователите разказват активирането на N343 гликан като сходно на " молекулен лост ".
Джейсън Маклелан (Jason McLellan), доцент по молекулярна биология в Тексаския университет в Остин и неговият екип основават разновидности на шиповия протеин и тестват по какъв начин неналичието на гликанова врата въздейства върху способността на RBD да се отваря.
" Ние показахме, че без тази врата RBD на шиповия протеин не може да стане нужната конформация, с цел да се инфектират клетките ", декларира Маклелан.
Публикуваното на 19 август в списание Nature Chemistry изследване разказва откриването на гликанови " порти ", които се отварят, с цел да разрешат навлизането на SARS-CoV-2.
Симулациите, ръководени от суперкомпютри, изобразяват гликана N343 (в магента - лилаво-червен цвят), работи като молекулен лост, с цел да отвори рецепторния свързващ домейн на SARS-CoV-2 или RBD (циан - синьо-зелен) от позиция „ надолу “ до „ нагоре “.
Източник: marica.bg
КОМЕНТАРИ