Още от създаването си тя е на подчинение на президента,

Още от основаването си тя е на послушание на президента, работи по закон едвам от 2015-а Макар да е службата с едвам 9 началници от структурирането си през 1990 година, в последно време НСО оставя усещане на най-проветривата. Причината е, че в последните 3 години в директорския кабинет се изредиха 4-ма души. Още от основаването си тя е на послушание на президента. Първият ѝ шеф е починалият вече Сава Джендов, който се задържа на поста 2 година На стола му сяда Димитър Владимиров - закрепостен е цели 12 години и напуща поста като пенсионер. В идващите 3 година го сменя Румен Миланов. Той също се пенсионира като началник на НСО. По негово време службата към този момент охранява водача на Движение за права и свободи тогава Ахмед Доган. Димитър Димитров изкарва 5 година, заменен е в първите месеци на мандата на президента Росен Плевнелиев. Заради персонални аргументи заместникът му Тодор Коджейков се задържа на поста единствено 2 година На негово място идва Ангел Антонов. Едва при него, през 2015 година, е признат Закон за НСО. Дотогава службата работи единствено по устав Всъщност признатият от Народното събрание нормативен акт е съвсем същия като остарелия. В него се записва, че охраняваните по закон са президентът, ръководителят на Народното събрание, министър председателят, основният прокурор и вицепрезидентът. Транспорт пък се поставя на министрите, зам.-шефовете на Народното събрание, ръководителите на висшите съдилища и членовете на Конституционен съд. Остана и защитата на няколко здания - “Евксиноград ”, обект “Шабла ”, комплекс “Бояна ”, Авиоотряд 28 и ВИП - “А ” Правителствена зала на летище София. Службата обезпечава и достъпа до постройките на Народното събрание, Министерския съвет и президенстството. Бе добавена обаче алинея за застрашени отвън висшите държавници, които могат да получат защита - “други лица, свързани с националната сигурност, похищението по отношение на които би подронило, отслабило или основало усложнения на властта в републиката ”. Така почетният към този момент ръководител на Движение за права и свободи Ахмед Доган остана с държавните гардове. Той е измежду най-дълго охраняваните от службата, които се пазят поради застрашеност. Гардове са му назначени в средата на първите години на новия век. Решението кой заплашен да се охранява се взима от комисия с членове шефовете на НСО и ДАНС и основния секретар на Министерство на вътрешните работи. Всеки има по 1 глас, два са задоволителни. През 2012 година с изключение на Доган службата пази още Румен Петков, Сергей Станишев, Георги Първанов, Яне Янев и Цветан Цветанов, разкрива в изявление за “24 часа ” тогавашният ѝ началник Тодор Коджейков. С държавни гардове се снабдява и Лютви Местан. Навръх Бъдни вечер през 2014 година Местан остава без защита. По същото време той е махнат като ръководител на Движение за права и свободи след рецензии от Доган поради декларация от парламентарната естрада в поддръжка на Турция след свалянето на съветски аероплан. Местан се укри в резиденцията на турския дипломат в София, а малко по-късно защитата му бе върната. Окончателно обаче му бе свалена през април 2017 година Делян Пеевски пък получава защита през 2016 година Причината - имало опасност, че се възнамерява убийството му. Тогава Министерство на вътрешните работи разкрило, че е нает апартамент с видимост, която давала опция за директен изстрел със снайпер по Пеевски. Заплахата бе оповестена от Министерство на вътрешните работи през февруари 2016 година Тогавашният основен секретар на ведомството Георги Костов изясни, че Пеевски в началото отказал защитата, само че по-късно бил уверен от НСО. Въпреки признатия закон ген. Антонов си потегля от НСО с два абсурда. В началото на 2018 година прокуратурата стартира инспекция, че той злоупотребява с ръководството на служебния автопарк и ловното стопанство “Кричим ”. В проверяваните сигнали се твърди, че генералът, който е разпален авджия, ловувал в “Кричим ” самичък или с приятели, които нощували там, а стопанството било на загуба. Плодове, зеленчуци и риба, създадени от фамилията на шефа, се консумирали от компанията. Ловните кучета на Антонов се хранели в стола на НСO. Излетите и хайките за дивеч били маскирани като командировки. На 31 януари 2018 година Антонов подава оставка, с цел да отиде консул в Санкт Петербург, а от инспекцията не се чу да се е потвърдила виновността му. Той остана на поста до 13 февруари, а в последните си дни претърпя различен скандал. На 8 февруари кола на НСО, в която се возеше първата дама Десислава Радева, бе преследвана от патрулка на полицията. Оказа се, че автомобилът не е бил с включени светлини, по тази причина от Министерство на вътрешните работи не са го разпознали. След Антонов някогашният началник на Военна полиция Данчо Дяков застава на поста на 1 март 2018 година По време на мандата му, траял година и половина, гръмна нов скандал с кола на НСО, която вози Радева Автомобилът е спрян от Министерство на вътрешните работи поради каране в насрещното на столичен бул.. Радева отхвърля да е била в колата. По времето на Дяков с защита се снабдява и Пламен Георгиев, тогава ръководител на антикорупционната комисия. Причината е, че е получил писмо с бесилка. Дяков подаде оставка в края на август 2019 година, а медийни изявления свързаха решението му с това, че първата дама ръководела службата. Самата тя иронизира слуховете. На поста му застана Красимир Станчев. По време на мандата му през май 2020 година е арестуван полковникът от службата Бисер Иванов с обвиняване, че е провел убийството на финансовата брокерка Станка Марангозова. Затова основният прокурор Иван Гешев се отхвърля от държавните гардове, взема решение да го пази Бюрото по отбрана, което му беше на послушание. Станчев напуща през юли м.г. Президентът самичък изиска оставката му поради абсурда на плажа Росенец, където гардове на НСО, охраняващи Ахмед Доган, захвърлиха националното знаме и блъскаха дебаркиралия с лодка Христо Иванов. Акцията на Иванов докара и до отпадането на защитата на Доган и Пеевски. Тогавашният министър председател Бойко Борисов изиска тя да бъде свалена, заповяда на основния секретар на Министерство на вътрешните работи и шефа на ДАНС да гласоподават махането ѝ. До избор обаче не се стигна - двамата сами се отхвърлиха от гардовете, тъй като “вече нямат доверие на принципала на службата ”. След като Станчев е освободен, на 31 юли м.г. Емил Тонев е назначен за краткотраен, а по-късно и непрекъснат началник на службата. В последните дни ексдепутатът от ИБГНИ Николай Хаджигенов изиска оставката му поради заличаване и укриване на записите с полицейско принуждение от митингите на 10 юли м.г.  По това време обаче Тонев е единствено заместител в службата. Самият той изясни предишния месец, че НСО има единствено един запис от камерата до Министерския съвет. Той бил пожелан от Столична дирекция на вътрешните работи на 16 юли и предаден още същия следобяд.