Компанията Basecamp Research представи първите в света модели с изкуствен

Компанията Basecamp Research показа първите в света модели с изкуствен интелект, способни да програмират вмъкването на гени – точно проникване на огромни ДНК фрагменти в избрани области на генома. Моделът EDEN, подготвен върху гигантска база данни за еволюцията, „ схваща “ езика на ДНК и проектира молекулярни принадлежности за тази задача. Това ще разреши да се основат да вземем за пример CAR-T кафези против рака и нови антибиотици за битка с резистентните инфекции.

Програмираното проникване на гени съставлява слагане на огромни лечебни ДНК последователности на тъкмо избрани места в човешкия геном. Съществуващите подходи, в това число CRISPR, разрешават единствено дребни промени и повреждат ДНК. Basecamp Research за първи път сподели, че изкуственият разсъдък може да проектира ензими за по-прецизно проникване на гените.

Платформата aiPGI, построена въз основата на еволюционните модели EDEN, е подготвена на „ езика на ДНК “ и моделите на еволюцията. Моделите получават като входни данни единствено целевия сектор от генома и основават дейни протеини за проникване, с цел да го модифицират. ИИ възнамерява последователността на дейностите, ревизира резултатите и поправя логаритъма, в случай че е належащо, като обезпечава тъкмо и безвредно редактиране на ДНК.

Учените от Basecamp Research към този момент са вмъкнали лечебни ДНК сектори допълнително от 10 000 места в разнообразни геноми, в това число в генома на първоначални човешки Т-клетки. По този метод са основани CAR-T кафези с висока противотуморна интензивност: в лабораторни опити те убиват над 90% от раковите кафези.

Моделите EDEN са употребявани и за основаване на библиотека от нови антимикробни пептиди, 97% от които демонстрират интензивност при лабораторните проби. Най-ефективните молекули се оправят с мултирезистентните „ супербактерии “. Това може да докара до нови принадлежности в битката с световната рецесия на лекарствената устойчивост.

EDEN е подготвен благодарение на над 10 трилиона токена еволюционна ДНК, събрани в продължение на пет години от 150 места в 28 страни и пет континента. Най-големият модел е подготвен на клъстер от повече от 1000 графични процесора NVIDIA Hopper и употребява ускоряване посредством библиотеките NVIDIA BioNeMo. Мащабът му е съпоставим с моделите на равнище GPT-4 и е измежду най-интензивните в изчислително отношение биологични модели, създавани в миналото.

Разработката на моделите EDEN и платформата aiPGI е осъществена взаимно с NVIDIA. Компанията Basecamp Research също по този начин притегли инвестиция от звеното за рисков капитал на NVIDIA, NVentures, преди кръга на финансиране от серия С. Тези средства ще оказват помощ за ускорение на по-нататъшните проучвания.

„ Вярваме, че сме при започване на огромно разширение на опциите за пациентите с рак и генетични болести “, споделя Джон Фин, основен теоретичен шеф на Basecamp Research. „ Като използваме изкуствен интелект за планиране на лечебния ензим, се надяваме да ускорим създаването на медикаменти за хиляди нелечими болести, което евентуално може да промени живота на милиони хора. “