Хонконгската обсерватория регистрира 158,1 мм (6,2 инча) валежи между 23:00 ч. в четвъртък и полунощ.
Времето Бюрото издаде предупреждение за черна дъждовна буря снощи - първото от почти две години - което остава в сила до 12:00 ч. в петък.
В него се казва, че повече от 200 мм (7,9 инча) валежи са били регистрирани на главния път на Хонконг остров, Коулун и североизточната част на новите територии на града от четвъртък вечерта - и призова жителите да останат в безопасност.
"Проливен дъжд ще доведе до внезапни наводнения", предупреждава той. „Жителите, живеещи в непосредствена близост до реки, трябва да бъдат нащрек за метеорологичните условия и да обмислят евакуация“, ако домовете им бъдат наводнени, се добавя.
Територията спря, тъй като проливният дъжд потопи улици, търговски центрове и метростанции, а властите затвориха училища и помолиха работниците да си останат вкъщи.
Видеоклипове в социалните медии показаха дъжда, който се лее, докато шофьорите се опитват да шофират през силно наводнените улици.
Един клип показа работници в метрото, които газят до кръста, докато се опитват да спрат водния поток, бликащ по ескалаторите и стълбите към гарата.
Изображенията също така показват превозно средство в дълбока дупка след срутване на участък от път - и пътища, блокирани от свлачища.
Прочетете още новини от света:
Климатични активисти прекъснаха US Open
Ким Чен Ун изстреля ядрена подводница
Актьор от Шоуто на 70-те в затвора за изнасилване p>
В изявление на правителството се казва, че лидерът на Хонконг Джон Лий е „много загрижен“ за тежките наводнения и е инструктирал всички отдели да „реагират с всички усилия“.
Всички училища ще бъдат спряно в петък поради „екстремни условия, причинени от обширни наводнения и сериозно прекъсване на трафика“, добави той.
Хонконгската фондова борса не отвори за сутрешната търговия в петък и каза, че ще остане затворена следобед ако предупреждението за черна дъждовна буря в града остане в сила по обяд.
Метеорологичното бюро приписва екстремните валежи на „ниско налягане“, свързано с остатъците от тайфуна Хайкуи, който по-рано тази седмица премина през Тайван и южнокитайската провинция Фудзиен.