Време е за малко по-задълбочен поглед върху варианта Омикрон
Анализът е от във фейсбук.
Преди няколко дни излезе препринт от значимо първо, което хвърля малко повече светлина върху обстановката. Направеният разбор демонстрира, че съотношението на риска от реинфектиране по отношение на риска от първична зараза е доста по-високо при актуалната вълна в Южна Африка, породена от Омикрон, спрямо това съответствие при предходни епидемиологични талази, дължащи се на по-ранни разновидности. Какво значи това? Накратко: Омикрон наподобява е кадърен да презаразява в доста по-висока степен от всички разновидности до момента. Т.е. за разлика от Делта да вземем за пример, който разчиташе на по-висока инфекциозност, с цел да си обезпечи разпространяване, Омикрон наподобява се осланя повече на дарба да пробива имунитета, с цел да заразява наново хора, прекарвали инфекцията.
Важна спогодба преди да продължа. Данните за обстановката към момента не са в обилие, в това число и при цитираното проучване. Това значи, че информацията към момента е непълна и надлежно, по нужда, разсъжденията ми тук ще се опират малко повече на фундаментални правила в епидемиологията и вирусната еволюция и на моите две + десетилетия професионален опит с вируси, в сравнение с обилие от информация, какъвто разкош за жалост към момента нямаме. В същото време, заради огромната значимост на тематиката, и отбелязвайки горните ограничавания, въпреки всичко е значимо да кажа нещата, които имам и мога да кажа във връзка с упованията ни за Омикрон. Постепенно, с излизането на нови данни, ще можем да забележим кои от тези кардинални разсъждения и прогнози ще се потвърдят изцяло, и кои по-малко.
В, която изнесох като посетител на Ковид-19 конференцията в София преди 2 седмици, в детайли се стопирах на различните еволюционни тактики, които можем да чакаме SARS CoV-2 да последва в разнообразни епидемиологични условия С появяването на Омикрон няколко дни по-късно, този разбор от лекцията стартира бързо да става все по-актуален. По тази причина ще се спра в резюме на някои от главните ми тези от този отчет.
Идеята е следната:
- Вирусите, както и всички организми еволюират в посока максимализиране на своята приспособеност (от термина fitness);
- На равнище популация от гостоприемници, най-хубавият метод да изразим приспособеността на един вирус, е посредством неговото репродуктивно число;
- Репродуктивното число на един вирус е мярка за неговата предаваемост и се дефинира като общият брой заразѐни, които един зара̀зен с този вирус субект поражда в популацията;
- Колкото по-високо е репродуктивното число на един вирус, толкоз по-добре той се предава сред гостоприемниците си;
- Колкото по-успешно се предава един заразен сътрудник, толкоз по-добре приспособен е той в еволюционно отношение;
- Но еволюционната доктрина ни споделя, че адаптираността (fitness) е постоянно относителна по отношение на средата, в която съществува даденият организъм. Т.е. организмите, включително и вирусите, се приспособяват към своята съответна среда и няма fitness по принцип. Това свойство постоянно е с оглед съответната среда;
- Оттук разумно поражда въпросът каква е разликата в упованията ни за посоката на еволюцията на SARS CoV-2 в две разнообразни среди. По-точно разликата сред посоката на вирусна еволюция в началните интервали на пандемията, когато доста хора са без имунитет (нито имунизирани, нито прекарали инфекция) и еволюционната му тактика през по-късните интервали на пандемията и след края ѝ, когато огромен дял от популацията ще има имунитет;
- Еволюционната доктрина планува, че в среда на имунологично наивно население (нямащи имунитет против SARS CoV-2), най-прекият път вирусът да си обезпечи висока предаваемост, т.е. да максимизира репродуктивното си число, е да закрепи в себе си разновидности, които го върша по-заразен;
- Точно това е и което наблюдавахме и при Алфа, и при Делта разновидностите от началото на пандемията. Всеки от тези разновидности беше артикул на еволюция, която го беше направила почти 50% по-заразен от предшестващите го вирусни разновидности. И всеки от тях измести и господства над до тогава съществувалите разновидности заради конкурентното преимущество, което имаше пред тях;
- Но в условия на високо равнище на имунитет в популацията (бил той от естествени инфекции, или от ваксинация) елементарното увеличение на заразността към този момент не прави работа за максимизиране на способността на вируса да се предава, просто тъй като тук към този момент казусът е имунна устойчивост в индивидите - залостена врата, отбрана, която би трябвало някак да се разбие.
- В тези условия упованията ни от позиция на еволюционната логичност са вирусът да ускори закрепването в себе си на разновидности, които го вършат добър в продупчване на имунните отбрани и му дават опция да презаразява.
- В обстановка, в която преобладаващият брой гостоприемници (хора) в популацията имат имунна отбрана, най-прекият път към оптималната предаваемост на вируса към този момент не е посредством нараснала инфекциозност и прицелване в неимунизираното малцинство, а посредством дарба за презразяване и прицелване в безбрежното поле на към този момент ваксинираните хора.
- Според горното проучване, тъкмо това се случва е Южна Африка. Омикрон е качил риска от презаразяване, не риска от първа зараза.
- Ако тези резултати се потвърдят, това ще е мощна индикация че в изискванията на високо популационно равнище на имунитет в Южна Африка (главно поради доста огромен % прекарали инфекцията и ненапълно поради ваксинация) Омикрон се популяризира и измества другите разновидности посредством силата му да презаразява.
От всичко дотук произтичат няколко значими на практика следствия:
- Двата най-успешни до миг разновидността - Алфа и Делта, до момента се разпространяваха с преимущество измежду незаразявaни преди хора. Дотук наподобява че Омикрон може би ще " специализира " в прекарали инфекцията и вероятно имунизирани човеци. Обърнете внимание, тук не споделям че хора, които не са прекарали инфекцията, не могат да се заразят с Омикрон, а че измежду прекарвалите инфекцията този вид наподобява, че има огромно конкурентно преимущество пред всички други вирусни разновидности.
- От горното следва упованието, че Омикрон ще се популяризира по-лесно тук-там с висок имунитет в популацията - в страни, където е налице високо имунизационно покритие, като някои в Западна Европа, или където доста хора са прекарали инфекцията в предишното - някои елементи на Бразилия, Южна Африка и други
- Ако горната логичност е вярна, то можем също по този начин да чакаме в България Омикрон да навлиза малко по-бавно, в сравнение с други места. Колко по-бавно, зависи от доста фактори, и е мъчно да се планува.
- Но горното може изобщо да не е мотив за наслада, тъй като тази монета си има и противоположна страна (+ обърнете внимание на идващите две точки). Ако Омикрон заразява с преимущество непрекарали инфекцията, то разновидността Делта, който и в този момент е огромният ни проблем, заразява точно хора без имунитет, каквито, за жалост, към момента са преобладаващо хората в България.
- Ако Омикрон съумява да пробие отбраната от презаразяване, само че не и тази от тежко протичане и гибел, каквито са упованията ни въз основата на опита ни с други разновидности до момента, и с другите сезонни човешки коронавируси, то автоматизирано следва и изводът, че очевидно бързото разпространяване на Омикрон може да не се последва от бързо качване и на хоспитализациите и смъртните случаи.
- Всъщност това съответствува с началните наблюдения че инфекциите в Южна Африка протичат по леко . Въпреки че тези данни би следвало да се интерпретират внимателно, заради по-ниската междинна възраст на случаите там до момента, от Южна Африка не престават да постъпват индикации за по-ниски темпове на болничен банкет, на фона на доста висок към този момент брой инфектирани.
Да обобщим. Дотук Омикрон наподобява като да се популяризира по бързо от Делта. Както данни, по този начин и теоретични съображения и опит сочат че това е повече поради имунен пробив, в сравнение с поради по-голяма инфекциозност. Въпреки очевидно бързото му разпространяване, опита ни с други разновидности и коронавируси, ни кара със въздържан оптимизъм да чакаме естественият, и изключително ваксинационият имунитет, да държат положително равнище на отбрана от тежко протичане и от гибел по отношение на Омикрон, както и по отношение на предходните разновидности.
Всичко, което би трябвало да знаете за:
Рубриката “Анализи ” показва разнообразни гледни точки, не е наложително изразените отзиви да съответстват с публицистичната позиция на “Дневник ”.
Преди няколко дни излезе препринт от значимо първо, което хвърля малко повече светлина върху обстановката. Направеният разбор демонстрира, че съотношението на риска от реинфектиране по отношение на риска от първична зараза е доста по-високо при актуалната вълна в Южна Африка, породена от Омикрон, спрямо това съответствие при предходни епидемиологични талази, дължащи се на по-ранни разновидности. Какво значи това? Накратко: Омикрон наподобява е кадърен да презаразява в доста по-висока степен от всички разновидности до момента. Т.е. за разлика от Делта да вземем за пример, който разчиташе на по-висока инфекциозност, с цел да си обезпечи разпространяване, Омикрон наподобява се осланя повече на дарба да пробива имунитета, с цел да заразява наново хора, прекарвали инфекцията.
Важна спогодба преди да продължа. Данните за обстановката към момента не са в обилие, в това число и при цитираното проучване. Това значи, че информацията към момента е непълна и надлежно, по нужда, разсъжденията ми тук ще се опират малко повече на фундаментални правила в епидемиологията и вирусната еволюция и на моите две + десетилетия професионален опит с вируси, в сравнение с обилие от информация, какъвто разкош за жалост към момента нямаме. В същото време, заради огромната значимост на тематиката, и отбелязвайки горните ограничавания, въпреки всичко е значимо да кажа нещата, които имам и мога да кажа във връзка с упованията ни за Омикрон. Постепенно, с излизането на нови данни, ще можем да забележим кои от тези кардинални разсъждения и прогнози ще се потвърдят изцяло, и кои по-малко.
В, която изнесох като посетител на Ковид-19 конференцията в София преди 2 седмици, в детайли се стопирах на различните еволюционни тактики, които можем да чакаме SARS CoV-2 да последва в разнообразни епидемиологични условия С появяването на Омикрон няколко дни по-късно, този разбор от лекцията стартира бързо да става все по-актуален. По тази причина ще се спра в резюме на някои от главните ми тези от този отчет.
Идеята е следната:
- Вирусите, както и всички организми еволюират в посока максимализиране на своята приспособеност (от термина fitness);
- На равнище популация от гостоприемници, най-хубавият метод да изразим приспособеността на един вирус, е посредством неговото репродуктивно число;
- Репродуктивното число на един вирус е мярка за неговата предаваемост и се дефинира като общият брой заразѐни, които един зара̀зен с този вирус субект поражда в популацията;
- Колкото по-високо е репродуктивното число на един вирус, толкоз по-добре той се предава сред гостоприемниците си;
- Колкото по-успешно се предава един заразен сътрудник, толкоз по-добре приспособен е той в еволюционно отношение;
- Но еволюционната доктрина ни споделя, че адаптираността (fitness) е постоянно относителна по отношение на средата, в която съществува даденият организъм. Т.е. организмите, включително и вирусите, се приспособяват към своята съответна среда и няма fitness по принцип. Това свойство постоянно е с оглед съответната среда;
- Оттук разумно поражда въпросът каква е разликата в упованията ни за посоката на еволюцията на SARS CoV-2 в две разнообразни среди. По-точно разликата сред посоката на вирусна еволюция в началните интервали на пандемията, когато доста хора са без имунитет (нито имунизирани, нито прекарали инфекция) и еволюционната му тактика през по-късните интервали на пандемията и след края ѝ, когато огромен дял от популацията ще има имунитет;
- Еволюционната доктрина планува, че в среда на имунологично наивно население (нямащи имунитет против SARS CoV-2), най-прекият път вирусът да си обезпечи висока предаваемост, т.е. да максимизира репродуктивното си число, е да закрепи в себе си разновидности, които го върша по-заразен;
- Точно това е и което наблюдавахме и при Алфа, и при Делта разновидностите от началото на пандемията. Всеки от тези разновидности беше артикул на еволюция, която го беше направила почти 50% по-заразен от предшестващите го вирусни разновидности. И всеки от тях измести и господства над до тогава съществувалите разновидности заради конкурентното преимущество, което имаше пред тях;
- Но в условия на високо равнище на имунитет в популацията (бил той от естествени инфекции, или от ваксинация) елементарното увеличение на заразността към този момент не прави работа за максимизиране на способността на вируса да се предава, просто тъй като тук към този момент казусът е имунна устойчивост в индивидите - залостена врата, отбрана, която би трябвало някак да се разбие.
- В тези условия упованията ни от позиция на еволюционната логичност са вирусът да ускори закрепването в себе си на разновидности, които го вършат добър в продупчване на имунните отбрани и му дават опция да презаразява.
- В обстановка, в която преобладаващият брой гостоприемници (хора) в популацията имат имунна отбрана, най-прекият път към оптималната предаваемост на вируса към този момент не е посредством нараснала инфекциозност и прицелване в неимунизираното малцинство, а посредством дарба за презразяване и прицелване в безбрежното поле на към този момент ваксинираните хора.
- Според горното проучване, тъкмо това се случва е Южна Африка. Омикрон е качил риска от презаразяване, не риска от първа зараза.
- Ако тези резултати се потвърдят, това ще е мощна индикация че в изискванията на високо популационно равнище на имунитет в Южна Африка (главно поради доста огромен % прекарали инфекцията и ненапълно поради ваксинация) Омикрон се популяризира и измества другите разновидности посредством силата му да презаразява.
От всичко дотук произтичат няколко значими на практика следствия:
- Двата най-успешни до миг разновидността - Алфа и Делта, до момента се разпространяваха с преимущество измежду незаразявaни преди хора. Дотук наподобява че Омикрон може би ще " специализира " в прекарали инфекцията и вероятно имунизирани човеци. Обърнете внимание, тук не споделям че хора, които не са прекарали инфекцията, не могат да се заразят с Омикрон, а че измежду прекарвалите инфекцията този вид наподобява, че има огромно конкурентно преимущество пред всички други вирусни разновидности.
- От горното следва упованието, че Омикрон ще се популяризира по-лесно тук-там с висок имунитет в популацията - в страни, където е налице високо имунизационно покритие, като някои в Западна Европа, или където доста хора са прекарали инфекцията в предишното - някои елементи на Бразилия, Южна Африка и други
- Ако горната логичност е вярна, то можем също по този начин да чакаме в България Омикрон да навлиза малко по-бавно, в сравнение с други места. Колко по-бавно, зависи от доста фактори, и е мъчно да се планува.
- Но горното може изобщо да не е мотив за наслада, тъй като тази монета си има и противоположна страна (+ обърнете внимание на идващите две точки). Ако Омикрон заразява с преимущество непрекарали инфекцията, то разновидността Делта, който и в този момент е огромният ни проблем, заразява точно хора без имунитет, каквито, за жалост, към момента са преобладаващо хората в България.
- Ако Омикрон съумява да пробие отбраната от презаразяване, само че не и тази от тежко протичане и гибел, каквито са упованията ни въз основата на опита ни с други разновидности до момента, и с другите сезонни човешки коронавируси, то автоматизирано следва и изводът, че очевидно бързото разпространяване на Омикрон може да не се последва от бързо качване и на хоспитализациите и смъртните случаи.
- Всъщност това съответствува с началните наблюдения че инфекциите в Южна Африка протичат по леко . Въпреки че тези данни би следвало да се интерпретират внимателно, заради по-ниската междинна възраст на случаите там до момента, от Южна Африка не престават да постъпват индикации за по-ниски темпове на болничен банкет, на фона на доста висок към този момент брой инфектирани.
Да обобщим. Дотук Омикрон наподобява като да се популяризира по бързо от Делта. Както данни, по този начин и теоретични съображения и опит сочат че това е повече поради имунен пробив, в сравнение с поради по-голяма инфекциозност. Въпреки очевидно бързото му разпространяване, опита ни с други разновидности и коронавируси, ни кара със въздържан оптимизъм да чакаме естественият, и изключително ваксинационият имунитет, да държат положително равнище на отбрана от тежко протичане и от гибел по отношение на Омикрон, както и по отношение на предходните разновидности.
Всичко, което би трябвало да знаете за:
Рубриката “Анализи ” показва разнообразни гледни точки, не е наложително изразените отзиви да съответстват с публицистичната позиция на “Дневник ”.
Източник: dnevnik.bg
КОМЕНТАРИ